根瘤菌的分类简述

Wedding Bus 官方 2024-06-21 14:03:21
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一个根瘤菌新种时至少需要多少菌株?
至少三个明显不同的菌株,这些不同指的是igs-pcr-rflps, rep-pcr or aflp genomic fingerprints, sequence data等,菌株应属于不同的地理来源或不同的宿主来源。总之,只有一个菌株来定根瘤菌新种绝对不行。

多少个分子标记方法要采用?
种内要用高分辩率的方法,如rep-pcr,aflp等进行区分,并用至少3个编码蛋白序列的基因进行比较分析。reca 和rpob是必须分析的两个基因。再加上至少一个共生基因,如nifh, noda和nodc等。16s rdna序列是必须要的,并且是几乎全长的序列。

表型测定要做多少?
做尽量多的交叉结瘤实验。 菌株的生长温度范围、ph,对盐的耐受度,对c、n的利用,对抗生素的抗性,脂肪酸分析。

dna杂交?
能做最好,将新单元的几株菌之间做杂交,看它们之间的相似性。做与最相关的参比菌株的杂交。我们更希望通过多位点分析结合表型特征来定一个新种。 20210311
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