逐步判别分析中method中为什么选fvalue

摘月亮的小仙女 2024-11-17 03:32:57
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§8.利用matlab和spss软件实现聚类分析  1. 用matlab编程实现  运用matlab中的一些基本矩阵计算方法,通过自己编程实现聚类算法,在此只讨论根据最短距离规则聚类的方法。  调用函数:  min1.m——求矩阵最小值,返回最小值所在行和列以及值的大小  min2.m——比较两数大小,返回较小值  std1.m——用极差标准化法标准化矩阵  ds1.m——用绝对值距离法求距离矩阵  cluster.m——应用最短距离聚类法进行聚类分析  print1.m——调用各子函数,显示聚类结果  聚类分析算法  假设距离矩阵为vector, a阶,矩阵中最大值为max,令矩阵上三角元素等于max  聚类次数=a-1,以下步骤作a-1次循环:  求改变后矩阵的阶数,计作c  求矩阵最小值,返回最小值所在行e和列f以及值的大小g  for l=1:c,为vector(c+1,l)赋值,产生新类  令第c+1列元素,第e行和第f行所有元素为,第e列和第f列所有元素为max  源程序如下:  %std1.m,用极差标准化法标准化矩阵  function std=std1(vector)  max=max(vector); %对列求最大值  min=min(vector);  [a,b]=size(vector); %矩阵大小,a为行数,b为列数  for i=1:a  for j=1:b  std(i,j)= (vector(i,j)-min(j))/(max(j)-min(j));  end  end  %ds1.m,用绝对值法求距离  function d=ds1(vector);  [a,b]=size(vector);  d=zeros(a);  for i=1:a  for j=1:a  for k=1:b  d(i,j)=d(i,j)+abs(vector(i,k)-vector(j,k));  end  end  end  fprintf('绝对值距离矩阵如下:\n');  d**p(d)  %min1.m,求矩阵中最小值,并返回行列数及其值  function [v1,v2,v3]=min1(vector);%v1为行数,v2为列数,v3为其值  [v,v2]=min(min(vector'));  [v,v1]=min(min(vector));  v3=min(min(vector));  %min2.m,比较两数大小,返回较小的值  function v1=min(v2,v3);  if v2>v3  v1=v3;  else  v1=v2;  end  %cluster.m,最短距离聚类法  function result=cluster(vector);  [a,b]=size(vector);  max=max(max(vector));  for i=1:a  for j=i:b  vector(i,j)=max;  end  end;  for k=1:(b-1)  [c,d]=size(vector);  fprintf('第%g次聚类:\n',k);  [e,f,g]=min1(vector);  fprintf('最小值=%g,将第%g区和第%g区并为一类,记作g%g\n\n',g,e,f,c+1);  for l=1:c  if l<=min2(e,f)  vector(c+1,l)=min2(vector(e,l),vector(f,l));  else  vector(c+1,l)=min2(vector(l,e),vector(l,f));  end  end;  vector(1:c+1,c+1)=max;  vector(1:c+1,e)=max;  vector(1:c+1,f)=max;  vector(e,1:c+1)=max;  vector(f,1:c+1)=max;  end  %print1,调用各子函数  function print=print1(filename,a,b); %a为地区个数,b为指标数  fid=fopen(filename,'r')  vector=fscanf(fid,'%g',[a b]);  fprintf('标准化结果如下:\n')  v1=std1(vector)  v2=ds1(v1);  cluster(v2);  %输出结果  print1('fname',9,7)  2.直接调用matlab函数实现  2.1调用函数  层次聚类法(hierarchical clustering)的计算步骤:  ①计算n个样本两两间的距离{dij},记d  ②构造n个类,每个类只包含一个样本;  ③合并距离最近的两类为一新类;  ④计算新类与当前各类的距离;若类的个数等于1,转到5);否则回3);  ⑤画聚类图;  ⑥决定类的个数和类;  matlab软件对系统聚类法的实现(调用函数说明):  cluster 从连接输出(linkage)中创建聚类  clusterdata 从数据集合(x)中创建聚类  dendrogram 画系统树状图  linkage 连接数据集中的目标为二元群的层次树  pd**t 计算数据集合中两两元素间的距离(向量)  squareform 将距离的输出向量形式定格为矩阵形式  zscore 对数据矩阵 x 进行标准化处理  各种命令解释  ⑴ t = clusterdata(x, cutoff)  其中x为数据矩阵,cutoff是创建聚类的临界值。即表示欲分成几类。  以上语句等价与以下几句命令:  y=pd**t(x,’euclid’)  z=linkage(y,’single’)  t=cluster(z,cutoff)  以上三组命令调用灵活,可以自由选择组合方法!  ⑵ t = cluster(z, cutoff)  从逐级聚类树中构造聚类,其中z是由语句likage产生的(n-1)×3阶矩阵,cutoff是创建聚类的临界值。  ⑶ z = linkage(y) z = linkage(y, 'method')  创建逐级聚类树,其中y是由语句pd**t产生的n(n-1)/2 阶向量,’method’表示用何方法,默认值是欧氏距离(single)。有’complete’——最长距离法;‘**erage’——类平均距离;‘centroid’——重心法 ;‘ward‘——递增平方和等。  ⑷ y = pd**t(x) y = pd**t(x, 'metric')  计算数据集x中两两元素间的距离, ‘metric’表示使用特定的方法,有欧氏距离‘euclid’ 、标准欧氏距离‘seuclid’ 、马氏距离‘mahal’、明可夫斯基距离‘minkowski‘ 等。  ⑸ h = dendrogram(z) h = dendrogram(z, p)  由likage产生的数据矩阵z画聚类树状图。p是结点数,默认值是30。  2.2举例说明  设某地区有八个观测点的数据,样本距离矩阵如表1所示,根据最短距离法聚类分析。  %最短距离法系统聚类分析  x=[7.90 39.77 8.49 12.94 19.27 11.05 2.04 13.29;  7.68 50.37 11.35 13.3 19.25 14.59 2.75 14.87;  9.42 27.93 8.20 8.14 16.17 9.42 1.55 9.76;  9.16 27.98 9.01 9.32 15.99 9.10 1.82 11.35;  10.06 28.64 10.52 10.05 16.18 8.39 1.96 10.81];  bx=zscore(x); % 标准化数据矩阵  y=pd**t(x) % 用欧氏距离计算两两之间的距离  d=squareform(y) % 欧氏距离矩阵  z = linkage(y) % 最短距离法  t = cluster(z,3) 等价于 { t=clusterdata(x,3) }  find(t==3) % 第3类集合中的元素  [h,t]=dendrogram(z) % 画聚类图  聚类谱系图如图1所示:  图1 聚类谱系图  3.用spss软件实现聚类分析  在spss软件中同样可以实现该算法,  例如:下表是1999年**省、自治区的城市规模结构特征的一些数据,可通过聚类分析将这些省、自治区进行分类,具体过程如下:  省、自治区 首位城市规模(万人) 城市首位度 四城市指数 基尼系数 城市规模中位值(万人)  京津冀 699.70 1.437 1 0.936 4 0.780 4 10.880  山西 179.46 1.898 2 1.000 6 0.587 0 11.780  ** 111.13 1.418 0 0.677 2 0.515 8 17.775  辽宁 389.60 1.918 2 0.854 1 0.576 2 26.320  吉林 211.34 1.788 0 1.079 8 0.456 9 19.705  黑龙江 259.00 2.305 9 0.341 7 0.507 6 23.480  苏沪 923.19 3.735 0 2.057 2 0.620 8 22.160  浙江 139.29 1.871 2 0.885 8 0.453 6 12.670  安徽 102.78 1.233 3 0.532 6 0.379 8 27.375  福建 108.50 1.729 1 0.932 5 0.468 7 11.120  江西 129.20 3.245 4 1.193 5 0.451 9 17.080  山东 173.35 1.001 8 0.429 6 0.450 3 21.215  河南 151.54 1.492 7 0.677 5 0.473 8 13.940  湖北 434.46 7.132 8 2.441 3 0.528 2 19.190  湖南 139.29 2.350 1 0.836 0 0.489 0 14.250  广东 336.54 3.540 7 1.386 3 0.402 0 22.195  广西 96.12 1.228 8 0.638 2 0.500 0 14.340  海南 45.43 2.191 5 0.864 8 0.413 6 8.730  川渝 365.01 1.680 1 1.148 6 0.572 0 18.615  云南 146.00 6.633 3 2.378 5 0.535 9 12.250  贵州 136.22 2.827 9 1.291 8 0.598 4 10.470  ** 11.79 4.151 4 1.179 8 0.611 8 7.315  陕西 244.04 5.119 4 1.968 2 0.628 7 17.800  甘肃 145.49 4.751 5 1.936 6 0.580 6 11.650  青海 61.36 8.269 5 0.859 8 0.809 8 7.420  宁夏 47.60 1.507 8 0.958 7 0.484 3 9.730  ** 128.67 3.853 5 1.621 6 0.490 1 14.470  (1)打开数据文件,在spss中可以打开多种类型的文件,如*.xls、*.dbf、*.txt、*.s**等,  file→open→data;  (2)进行聚类分析:analyze→classify→hierarchical cluster(此例子中用层次聚类法);  进入如下对话框,设置聚类变量,以及采用的聚类方法,是否显示聚类谱系图等(因为采用不同的聚类方法,分类结果不同)。  设置完成后,即可得到聚类结果,此例子中采用欧式距离计算样本之间各变量的距离,组平均法聚类,得到聚类谱系图, 20210311
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